Ziheng Yang
（2006年12月刊行，Oxford University Press［Oxford Series in Ecology and Evolution］， ISBN:0198566999[hbk] / ISBN:0198567022 [pbk]）
最尤法とベイズ法に基づく系統推定の教科書（“最終兵器”ですか？）．Joe Felsenstein『Inferring Phylogenies』のお供に．次は，長らく予告されている John Huelsenbeckの『Statistical Phylogenetics』かな．
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Preface
1. Models of Nucleotide Substitution
2. Models of Amino Acid and Codon Substitution
3. Phylogeny Reconstruction: Overview
4. Maximum Likelihood Methods
5. Bayesian Methods
6. Comparison of Methods and Tests on Trees
7. Molecular Clock and Estimation of Species Divergence Times
8. Neutral and Adaptive Protein Evolution
9. Simulating Molecular Evolution
10. Perspectives
Appendixes
Reference
