『Tree Thinking: An Introduction to Phylogenetic Biology』

David A. Baum and Stacey D. Smith

(2013年刊行,Roberts and Company, Greenwood Village, xx+476 pp., ISBN:9781936221165 [hbk] → 版元ページ

系統樹思考(tree-thinking)」と銘打たれた生物体系学の入門書.生物学哲学の「妖怪」どもにはいっさい言及せず,系統学の基本的知識の定着を目指す.章末には演習問題(クイズ)が配置され,初学者にとっては学びやすい本だろう.このタイプの生物体系学教科書は最近の中南米では何冊も出ているが,英語圏では久しぶりかもしれない.ざっとブラウズした感じでは,すでに絶版のE・O・ワイリー他[宮正樹訳]『系統分類学入門:分岐分類の基礎と応用』(1992年刊行, 文一総合出版)に近い雰囲気.500ページもある本書は系統学のツールを身につけるには適した教材となるだろう.生物学哲学が好きな向きにはかなり不満が残るかも.その意味では「系統樹ユーザー」向けの本.なお著者はふたりとも植物学者なので,取り上げられている実例は植物が多いかもしれない.こういう教科書を半年くらいかけてしっかり勉強すれば,「系統樹リテラシー」はかなり身につくのではないだろうか.分子系統学についてももちろん詳しく解説されているが,「数式含有率」がほぼゼロなので,読者にとっての敷居は十分に低いだろう.

【目次】
Preface xv
About the Authors xix

Part I: Introduction



1. Introduction to phylogenetic trees and their importance in modern biology 1

Part II: Interpreting Trees



2. Tree thinking and its importance in the development of evolutionary thought 9
3. What a phylogenetic tree represents 35
4. Trait evolution 77
5. Relatedness and biological classification 107
6. Gene trees and species trees 139

Part III: Inferring Trees



7. Phylogenetic inference with parsimony 173
8. Phylogenetic inference with distance, maximum likelihood and Bayesian methods317
9. Statistical tests of phylogenetic hypotheses 265

Part IV: Using Trees



10. Using trees to study character evolution 305
11. Using trees to study space, time, and evolutionary diversification 349

Part V: Appendices


Appendix 1: Data for phylogenetic analysis 389
Appendix 2: Generating a morphological data matrix 399
Answers to chapter quizzes 405
References 425
Glossary 439
Index 459